Dalam bidang patologi, spesimen biologi seperti sel atau tissue manusia akan di kaji melalui mikroskop elektron untuk mengdiagnos penyakit dan sebagainya. Salah satu limitasi sewaktu memeriksa dan analisis spesimen menggunakan mikroskop elektron adalah kontra warna spesimen. Ini bermaksud, pengkaji sukar untuk melihat setiap komponen-komponen dalam sel secara jelas.
Oleh yang demikian, satu teknik diperkenalkan iaitu ‘staining’ atau pewarnaan. Terdapat beberapa cara melakukan pewarnaan. Salah satunya ‘Haematoxylin and Eosin (H&E) staining’. Dalam cara ini, bahan kimia haemotoxylin(bewarna biru-unggu) akan mewarnakan nuklues sel manakala, bahan kimia eosin( bewarna merah jambu) akan mewarnakan sitoplasma selepas celupan dilakukan menggunakan kedua-dua bahan kimia ini. Hasilnya, terdapat kontra warna pada sel-sel yang ingin dikaji.